Об особенностях формирования бухгалтерской отчетности при слиянии юридических лиц говорится в  разделе IV Методических указаний.
При слиянии юридических лиц их   права и обязанности приобретает вновь возникшее  юридическое  лицо согласно  передаточному  акту (п. 1 ст. 58 ГК РФ)

При реорганизации в форме слияния на день, который предшествует  внесению в Реестр записи о возникшей организации, всеми  реорганизуемыми  предприятиями, прекращающими  свою деятельность, составляется  заключительная  бухгалтерская  отчетность с закрытием счетов учета прибылей и убытков (п.15 Методических указаний).

К тому же,  с даты, когда был утвержден   передаточный  акта  до даты внесения в Реестр записи о возникшем при реорганизации в форме слияния юридическом лице, в бухгалтерском учете необходимо отразить  все операции, которые связаны с текущей деятельностью реорганизуемых предприятий наряду с  расходами, произведенными  в связи с реорганизацией. Обо всех этих расходах необходимо указать   в  заключительной бухгалтерской отчетности  прекращающих свою деятельность организаций.

Данные передаточного акта и построчного объединения (суммирования или вычитания при наличии непокрытых убытков прошлых лет) числовых показателей заключительной бухгалтерской отчетности реорганизованных предприятий служат основой вступительной бухгалтерской отчетности организации, которая возникла в результате слияния, на момент ее государственной регистрации.
Следует знать, что суммирования числовых показателей отчетов о прибылях и убытках реорганизуемых предприятий во вступительной бухгалтерской отчетности организации, которая возникла  в результате слияния,  не производится.

Согласно пункту 19 Методических указаний, в случае предусмотренного  договором о слиянии  увеличения  уставного капитала возникшего предприятия по сравнению с суммой уставных капиталов реорганизуемых организаций , в том числе за счет собственных источников участвующих в реорганизации в форме слияния юридических лиц (добавочного капитала, нераспределенной прибыли и т.д.), вступительная  бухгалтерская  отчетность  возникшей организации должна отражать  величину уставного капитала, зафиксированную  в договоре о слиянии.

Так же, уменьшение величины уставного капитала у возникшей организации,  предусмотренное  в договоре о слиянии, должно быть отражено во  вступительной   бухгалтерской   отчетности  возникшего предприятия, с урегулированием разницы  во вступительном бухгалтерском балансе правопреемника  числовым показателем "Нераспределенная прибыль (непокрытый убыток)" раздела "Капитал и резервы".

В ситуации, когда происходит несовпадение  величины уставного капитала, предусмотренной  договором о слиянии  со стоимостью чистых активов возникшего предприятия,  нужно отражать  соответствующие разницы  по числовым показателям "Добавочный капитал" и "Нераспределенная прибыль (непокрытый убыток)" в разделе "Капитал и резервы" вступительного бухгалтерского баланса.