В качестве   оценки  передаваемого (принимаемого) при реорганизации юридического лица имущества,  производимой  согласно решению учредителей, которое отражено  в решении (договоре) о реорганизации берется, в соответствии с пунктом 7 Методических указаний:
либо остаточная стоимость;
либо  текущая рыночная стоимость;
либо  иная стоимость (фактическая  себестоимость материально-производственных запасов, первоначальная  стоимость финансовых вложений и др.).

При этом  должно происходить совпадение  стоимости имущества, отраженного в передаточном акте или разделительном балансе, с данными, которые приведены в приложениях (описях, расшифровках) к ним.

Оценку обязательств реорганизуемого предприятия в передаточном акте или разделительном балансе следует отражать  в сумме, по которой кредиторскую  задолженность отразили  в бухгалтерском учете, учитывая  суммы убытков, причитающихся возмещению кредиторам в соответствии с российским законодательством.

Согласно  пунктам 9 и 10 Методических указаний, процедурой реорганизации юридических лиц при оставлении бухгалтерского учета предусматривается отдельное составление заключительной и промежуточной (годовой) бухгалтерской отчетности.

В Положении  по бухгалтерскому учету "Бухгалтерская отчетность организации" ПБУ 4/99, утвержденном приказом Минфина России от 06.07.1999 № 43н говорится о том,  что   реорганизуемое  юридическое  лицо, которое прекращает  свою деятельность, обязано составить  заключительную  бухгалтерскую  отчетность на день, который предшествует  дате внесения в Реестр соответствующей записи:
о возникших организациях - при реорганизации в формах слияния, разделения и преобразования;
о прекращении деятельности последней из присоединенных организаций  - при реорганизации в форме присоединения.

Составляя  заключительную  бухгалтерскую  отчетность необходимо произвести закрытие счетов учета прибылей и убытков и направить  (распределить) суммы чистой прибыли на цели, которые определены решением (договором) учредителей.

При несовпадении   даты  передачи имущества и обязательств реорганизуемого предприятия на основе передаточного акта или разделительного баланса  и даты   внесения в Реестр соответствующей записи о возникших организациях (о прекращении деятельности последней из присоединенных организаций),    реорганизуемому   юридическому   лицу необходимо составить  и представить  промежуточную  и (или) годовую  бухгалтерскую  отчетность. Это делается в возникший промежуток времени между этими датами, и возможно несоответствие числовых показателей  промежуточной и (или) годовой, а затем и заключительной бухгалтерской отчетности данным передаточного акта или разделительного баланса.

Информацию  о  возникающих в этот период изменениях  в стоимости передаваемого имущества и обязательств  вносят    в пояснительную  записку  к промежуточной и (или) годовой бухгалтерской отчетности, заключительной бухгалтерской отчетности,  либо в уточнения  к передаточному акту или разделительному балансу.

Когда  составление передаточного акта или разделительного баланса происходит непосредственно перед представлением соответствующих документов для государственной регистрации возникших (прекративших  деятельность ) реорганизуемых предприятий, оценка передаваемого имущества - по остаточной стоимости (фактической себестоимости, первоначальной стоимости), а обязательств - в сумме, по которой задолженность  отразили  в бухгалтерском учете,  возможно соответствие числовых  показателей  промежуточной и (или) годовой и заключительной бухгалтерской отчетности  данным передаточного акта или разделительного баланса  (пункт 10 Методических указаний).

Передачу имущества при реорганизации юридических лиц  можно считать  передачей права собственности на это имущество. Потому возникает определенная  сложность при  квалификации  фактов такой передачи при составлении  бухгалтерского учета, в связи с возникающим вопросом: должны  ли в соответствии с пунктом 12 ПБУ 9/99 рассматриваться  данные операции как продажи.

Пункт 11 комментируемого нормативного документа устанавливает, что передачу имущества и обязательств  при реорганизации по передаточному акту или разделительному балансу от одной организации к другой в порядке универсального правопреемства не нужно рассматривать  как продажу  имущества и обязательств или как безвозмездную  их передачу.

Передачу имущества и обязательств по передаточному акту или разделительному балансу организация, которая передает  имущество и обязательства в порядке правопреемства, в бухгалтерских  записях  не отражает.

Согласно пункту 12 Методических указаний,  расходы на реорганизацию (государственную  регистрацию возникших организаций, внесение соответствующих изменений в учредительные документы, регистрацию  ценных бумаг, оплату  юридических услуг и др.), юридические  лица, участвующие  в реорганизации, признают  как  внереализационные  расходы  соответствующего периода и отражают  в бухгалтерском учете организации, которая  осуществляет  эти расходы. Отчет о прибылях и убытках организации, осуществляющей эти расходы, должен содержать указанные внереализационные расходы независимо от их существенности по отдельной строке.
При  составлении вступительной бухгалтерской отчетности вновь созданного (преобразованного) в результате реорганизации юридического лица,   на начало отчетного периода (дату государственной регистрации) данные об имуществе, обязательствах и других числовых показателях   заполняются   на основе   передаточного акта или разделительного баланса, а также заключительной бухгалтерской отчетности реорганизованных юридических лиц, которая составлена  с учетом возникших изменений в составе и стоимости передаваемого имущества и обязательств  ( пункт 13 Методических указаний).

В пункте 14 комментируемого нормативного акта специально оговорено, что начисление амортизации по основным средствам, доходным вложениям в материальные ценности и нематериальным активам предприятий, которые возникли  в результате реорганизации (исключение составляет  реорганизация в форме преобразования), следует производить  с 1 числа месяца, следующего за месяцем, в котором была осуществлена их государственная регистрация. Амортизацию  начисляют  исходя из срока полезного использования объекта и способа начисления амортизации, которые определяются  юридическими лицами, возникшими в результате реорганизации ( исключение -  реорганизация в форме преобразования), согласно   Положению  по бухгалтерскому учету "Учет основных средств" ПБУ 6/01, утвержденному  приказом Минфина России от 30.03.2001 № 26н.